Статья "Применение последовательностей внутренних транскри..."

Наименование статьиПрименение последовательностей внутренних транскрибируемых спейсеров (ITS) для идентификации образцов Anoectochilus setaceus Blume в Тханьхоа (Вьетнам)
Страницы108
Аннотация Актуальность. Термин «DNA barcode» широко используется в молекулярной таксономии. По существу, этот метод основан на использовании последовательности ДНК (около 400–800 пн) в качестве стандарта для быстрой и точной идентификации и определения видовых отношений организмов. Таким образом, ДНК-штрихкоды помогают систематикам не только классифицировать и идентифицировать виды, но и контролировать, понимать и использовать биоразнообразие. В настоящем исследовании авторы провели идентификацию образцов Anoectochilus setaceus Blume, собранных в провинции Тханьхоа, на основе анализа последовательностей ITS. Материалы и методы. Тотальную ДНК выделяли из молодых листьев образцов A. setaceus с использованием бромида цетилтриметиламмония (CTAB-метод). Сегмент гена ITS амплифицировали методом ПЦР и секвенировали. Эту генетическую последовательность анализировали, сравнивали и использовали для построения «филогенетичеческого древа» с помощью программ BioEdit, BLAST, DNASTAR. Результаты и выводы. Нами выделены 4 последовательности генной области ITS из 4 образцов A. setaceus, собранных в Сюань Лиен и Пу Луонг провинции Тханьхоа; изученный ITS-регион имел длину 667 нуклеотидов. Полученные данные идентифицировали образцы как один и тот же вид и показали 99-процентное сходство с последовательностью ITS A. roxburghii (Wall.) Lindl., опубликованной в базе данных GenBank (GQ328774). Исследование также демонстрирует, что использование внутреннего транскрибируемого спейсера (ITS) является эффективным методом для идентификации образцов A. setaceus.
ЖурналТруды по прикладной ботанике, генетике и селекции
Номер выпуска2
Автор(ы)Тхинь Б. Б., Чак Л. Д., Тху Т. М.