Статья "Solanum nigrum L. – резерватор вироида веретеновид..."
Наименование статьи | Solanum nigrum L. – резерватор вироида веретеновидности клубней картофеля |
---|---|
Страницы | 194 |
Аннотация | Актуальность. Среди сорных растений семейства пасленовых, потенциальных резерваторов инфекции вироида веретеновидности клубней картофеля (ВВКК), паслен черный (Solanum nigrum L.) повсеместно распространен на территории России. Материалы и методы. Молекулярную диагностику вироида проводили методом ПЦР с обратной транскрипцией с использованием праймеров P3/P4, специфичных для ВВКК, и 6Pospi F/R, специфичных для семейства вироидов Pospiviroidae. Продукты амплификации клонировали и секвенировали, нуклеотидные последовательности депонировали в базе данных GenBank. Результаты. Методом ОТ-ПЦР показано, что 80–100% растений, собранных в Нижнем Новгороде и Тульской области, были инфицированы ВВКК. кДНК-ампликоны двух растений из Нижнего Новгорода (Sn1 и Sn2) и одного растения из Тульской области (Sn3) клонировали, по три клона каждого, и секвенировали. Анализ нуклеотидной изменчивости клонов выявил существенные генетические различия между штаммами ВВКК, при этом связь с географическим происхождением штаммов не наблюдается. Мутации U120C и U192C относительно референсного штамма VP35 (LC523658) обнаружены у всех 9 клонов. Изолят Sn1 близок к «картофельному» изоляту VP35 и отличается от него тремя мутациями. Изолят Sn2 представлен тремя идентичными клонами и отличается от VP35 девятью мутациями, а Sn3 имеет 22 мутации в области 49–310 позиции нуклеотидов суммарно для трех клонов. После искусственного заражения здоровых растений S. nigrum в условиях теплицы подтвержден факт наличия ВВКК в инфицированных растениях и доказано, что вироид передается семенами растениям следующей генерации. Заключение. Впервые во внешне здоровых сорных растениях S. nigrum выявлен вироид веретеновидности клубней картофеля – ВВКК. Доказано, что вироид сохраняется в семенах S. nigrum и передается потомству. Обнаружена генетическая гетерогенность штаммов ВВКК, обитающих в растениях S. nigrum. Две мутации U120C и U192C были общими для всех тестированных клонов изолятов ВВКК, обнаруженных в S. nigrum. |
Ключевые слова | паслен черный, ВВКК, ОТ-ПЦР, секвенирование, мутации. |
Журнал | Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции |
Номер выпуска | 3 |
Автор(ы) | Мироненко Н. В., Хютти А. В., Кырова Е. И., Лашина Н. М., Афанасенко О. С. |