Статья "Solanum nigrum L. – резерватор вироида веретеновид..."

Наименование статьиSolanum nigrum L. – резерватор вироида веретеновидности клубней картофеля
Страницы194
АннотацияАктуальность. Среди сорных растений семейства пасленовых, потенциальных резерваторов инфекции вироида веретеновидности клубней картофеля (ВВКК), паслен черный (Solanum nigrum L.) повсеместно распространен на территории России. Материалы и методы. Молекулярную диагностику вироида проводили методом ПЦР с обратной транскрипцией с использованием праймеров P3/P4, специфичных для ВВКК, и 6Pospi F/R, специфичных для семейства вироидов Pospiviroidae. Продукты амплификации клонировали и секвенировали, нуклеотидные последовательности депонировали в базе данных GenBank. Результаты. Методом ОТ-ПЦР показано, что 80–100% растений, собранных в Нижнем Новгороде и Тульской области, были инфицированы ВВКК. кДНК-ампликоны двух растений из Нижнего Новгорода (Sn1 и Sn2) и одного растения из Тульской области (Sn3) клонировали, по три клона каждого, и секвенировали. Анализ нуклеотидной изменчивости клонов выявил существенные генетические различия между штаммами ВВКК, при этом связь с географическим происхождением штаммов не наблюдается. Мутации U120C и U192C относительно референсного штамма VP35 (LC523658) обнаружены у всех 9 клонов. Изолят Sn1 близок к «картофельному» изоляту VP35 и отличается от него тремя мутациями. Изолят Sn2 представлен тремя идентичными клонами и отличается от VP35 девятью мутациями, а Sn3 имеет 22 мутации в области 49–310 позиции нуклеотидов суммарно для трех клонов. После искусственного заражения здоровых растений S. nigrum в условиях теплицы подтвержден факт наличия ВВКК в инфицированных растениях и доказано, что вироид передается семенами растениям следующей генерации. Заключение. Впервые во внешне здоровых сорных растениях S. nigrum выявлен вироид веретеновидности клубней картофеля – ВВКК. Доказано, что вироид сохраняется в семенах S. nigrum и передается потомству. Обнаружена генетическая гетерогенность штаммов ВВКК, обитающих в растениях S. nigrum. Две мутации U120C и U192C были общими для всех тестированных клонов изолятов ВВКК, обнаруженных в S. nigrum.
Ключевые словапаслен черный, ВВКК, ОТ-ПЦР, секвенирование, мутации.
ЖурналТруды по прикладной ботанике, генетике и селекции
Номер выпуска3
Автор(ы)Мироненко Н. В., Хютти А. В., Кырова Е. И., Лашина Н. М., Афанасенко О. С.