| Наименование статьи | Идентификационный потенциал комплексной детекции диагностически значимых SNPs BoLA-DRB3 методом секвенирования |
|---|
| Страницы | 4-10 |
|---|
| Аннотация | BoLA-DRB3 - один из высокополиморфных генов лейкоцитарного антигена (Bovine Leukocyte Antigen) класса ll главного комплекса гистосовместимости, ответственный за первичный иммунный ответ организма на бактериальную и вирусную инфекцию, и играющий ключевую роль врезистентности к лейкозу крупного рогатого скота. Определенный локус данного гена используется в качестве ДНК-маркера при установлении генетического статуса животного по отношению к лейкозу при скрининге аллелей устойчивости и чувствительности к указанному заболеванию молекулярно-генетическими методами, опирающимися на достоверные знания о полиморфизме BoLA-DRB3. Цель настоящего исследования заключалась в картировании полиморфных позиций в анализируемом локусе BoLA-DRB3-аллелей, в т. ч. диагностически значимых однонуклеотидных замен, с последующей оценкой идентификационного потенциала их комплексной детекции методом секвенирования для скрининга аллелей устойчивости и чувствительности клейкозу крупного рогатого скота. Анализ результата множественного выравнивания депонированных в базу данных lPD-MHC нуклеотидных последовательностей известных аллелей изучаемого гена осуществлен опираясь на версию библиотеки lPD-MHC v3.12.0. Экстракция ДНК из 65 образцов цельной консервированной крови крупного рогатого скота выполнена комплектом реагентов "ДНК-сорб B". Постановка ПЦР проведена набором реактивов "Encyclo Plus PCR kit" с праймерами DRB3FRW и DRB3REV, использованными и при секвенировании ПЦР-продукта на генетическом анализаторе "ABl PRlSM 3100". Биоинформационным анализом выровненных последовательностей локуса BoLA-DRB3-аллелей картировано не менее 97 выявленных полиморфных позиций SNPs и lnDels. Из них 21 полиморфная позиция нуклеотидных замен рассматривалась в качестве диагностически значимых SNPs. Идентификационный потенциал их комплексной детекции методом капиллярного секвенирования по Сэнгеру для скрининга аллелей устойчивости и чувствительности, раскрытый в настоящем исследовании, направлен на установление принадлежности идентифицируемых генотипов BoLA-DRB3 Bos taurus к определенной ассоциированной группе и выяснение генетического статуса исследуемого животного по отношению к лейкозу крупного рогатого скота. |
|---|
| Ключевые слова | крупный рогатый скот, лейкоз, резистентность, BoLA-DRB3, аллель, SNP, ПЦР, секвенирование |
|---|
| Журнал | Ветеринария и кормление |
|---|
| Номер выпуска | 4 |
|---|
| Автор(ы) | Вафин Р. Р., Гильманов Х. Х., Шастин П. Н., Капустин А. В. |
|---|