Статья "Идентификация участков гомозиготности у отечествен..."
Наименование статьи | Идентификация участков гомозиготности у отечественных и зарубежных пород свиней |
---|---|
Страницы | 2-9 |
Аннотация | В настоящее время исследования чаще всего ориентированы на поиск стабильных (закрепленных) генов, которые отвечают за жизнеспособность и хозяйственно-полезные признаки в изучаемых популяциях сельскохозяйственных животных. Одной из методологий является поиск и определение участков гомозиготности для выявления расположенных на данных сегментах генов, становление которых происходило за счет селекционного давления, и их можно выявить при понимании близкого или дальнего по времени близкородственного скрещивания в популяции. В связи с чем, в данном исследовании цель заключалась в идентификации участков гомозиготности по трем породам и аннотации генов по детектированным регионам ROH. По результатам исследований было выявлено 77 SNP и 383 гена. С помощью функциональной аннотации по биологическими библиотекам в веб-программе DAVID и базе данных Pig QTL обнаружено 18 генов на 1, 2, 4, 6, 7, 8, 9, 13 и 15 хромосомах. На первой хромосоме у крупной белой породы свиней выявлен значимый ген MC4R и для подтверждения его достоверности дополнительно проведен анализ полногеномных ассоциаций. Результаты работы позволяют уточнить достоверность гена MC4R, уже имеющего прикладное значение, а также, выявить новые гены, ассоциированные с необходимым функционалом организма, например, с адаптационными способностями организма, для последующего их включения в практикоориентированную работу. |
Ключевые слова | ROH, GWAS, структурная аннотация генов, функциональная аннотация генов, локальная порода свиней, коммерческая порода свиней |
Журнал | Зоотехния |
Номер выпуска | 7 |
Автор(ы) | Белоус А. А., Абдельманова А. С., Харзинова В. Р., Зиновьева Н. А. |