| Аннотация | Висна-маеди, или прогрессирующая пневмония овец, - лентивирусная инфекция овец, наносящая существенный экономический ущерб производителям. В результате полногеномных ассоциативных исследований SNP-генотипов инфицированных и неинфицированных овец установлено, что варианты в одном SNP в гене TMEM154 приводят к образованию более или менее восприимчивых к висна-маеди гаплотипов. Это создает предпосылки для снижения количества восприимчивых овец в стадах путем селекционных мер. В нашей работе мы изучили генетические взаимосвязи шести полутонкорунных пород овец, разводимых в России, с иностранными породами, рассчитали и проанализировали частоты встречаемости аллелей в SNP гена TMEM154 у шести полутонкорунных пород овец, разводимых в России. Выборка изучаемых овец включала горноалтайскую (n=28), цигайскую (n=16), куйбышевскую (n=16), русскую длинношерстную (n=32), северокавказскую мясошерстную (n=11) и южную мясную (n= 96) породы. Поиск резистентных и восприимчивых к висна-маеди гаплотипов был проведен в соответствие с методикой, предложенной Heaton MP et al. (2013). Генотипы в изучаемой позиции rs414338245 получены с ДНК-чипов и валидированы с использованием полных геномов. В качестве групп сравнения были использованы SNP-профили иностранных пород: иль-де-франс, лакон, голуэй, ромни-марш, дорсет, бордер лейстер, тексель. Частота встречаемости аллеля A варьировала от 32,14% у горноалтайской до 72,73% у северокавказской мясошерстной пород, частота восприимчивого аллеля G - от 27,27% у северокавказской мясошерстной до 67,86% у горноалтайской пород, соответственно. Генотип GG отсутствовал ввыборке северокавказской мясошерстной породе и варьировал от 18,75% в куйбышевской породе до 57,14% в горноалтайской породе. Частоты встречаемости генотипов AA и AG составили 6,25 - 45,45% и 21,43 - 58,33%, соответственно. Полученные результаты сопоставимы с данными, рассчитанными для иностранных пород. Рекомендуется внедрение целевого SNP гена TMEM154 в программы маркер-ориентированной селекции для профилактики висна-маеди в стадах овец. |
|---|