Статья "Исследования динамики генетической архитектуры сви..."

Наименование статьиИсследования динамики генетической архитектуры свиней крупной белой породы на основе данных SNP-анализа
Страницы16-19
АннотацияКрупная белая порода свиней, сформировавшаяся в результате скрещивания европейских и азиатских предковых форм, занимает ведущее положение в мировом свиноводстве благодаря выдающейся продуктивности и отличным мясным качествам. Однако её генетическая структура за последние два столетия претерпела значительные изменения вследствие интенсивной селекции и использования ограниченного числа высокопродуктивных линий. Современные молекулярно-генетические методы, включая полногеномное SNP-генотипирование, позволяют детально изучить динамику генетической архитектуры породы, выявить селекционные сигнатуры и оценить влияние длительного отбора на генетическое разнообразие. В данном исследовании проведён сравнительный анализ геномов современных (n = 98) и музейных (n = 16) образцов крупной белой породы, а также коммерческих пород (ландрас и дюрок). ДНК музейных образцов выделяли из зубов XX века с применением протоколов для древней ДНК, образцы анализировали с использованием ДНК-чипа GeneSeek® Porcine GGP HD. Шесть музейных образцов были удалены из анализа в связи с недостаточным качеством генотипирования. Оценку генетического разнообразия и структуры популяций с помощью программ PLINK1.9 и Admixture. Генетический анализ выявил дефицит гетерозиготности как в музейной (UFIS =0,041), так и в современной (UFIS =0,068) популяциях крупной белой породы, причем его выраженность была более значительной в современных образцах. Исследование генетической структуры показало наличие примесей в музейной популяции: доля общих генетических компонентов с современными представителями породы составила 15,87-33,63%. От 9,58 до 14,47% генетических компонентов приходилось на кластеры пород дюрок и ландрас соответственно, что может объясняться использованием общих предков этих пород при работе с крупной белой породой в ХХ веке.
Ключевые словакрупная белая порода, геномный анализ, SNP-генотипирование, генетическое разнообразие, музейные образцы
ЖурналЗоотехния
Номер выпуска7
Автор(ы)Цыб А. М., Харзинова В. Р., Абдельманова А. С., Чинаров Р. Ю., Боронецкая О. И., Зиновьева Н. А.