Статья "Идентификация STR-маркеров ДНК у алтае-саянской по..."

Наименование статьиИдентификация STR-маркеров ДНК у алтае-саянской породы маралов
Страницы6-9
АннотацияКлючевое значение для оптимизации селекционных программ, сохранения биоразнообразия и повышения продуктивности мараловодства Республики Тыва имеет детальное изучение генетической структуры маралов алтае-саянской породы. Микросателлитные маркеры (STR) являются высокоинформативным инструментом для генетической паспортизации, оценки уровня гетерозиготности и степени родства. Биологическим материалом служили образцы цельной крови, полученные от 47 голов маралов, содержащихся в хозяйстве ООО «Туран» (Республика Тыва). Выделение геномной ДНК осуществляли с использованием коммерческого набора реагентов «ДНК-Экстран-1». Генотипирование проводили по 16 микросателлитным локусам (BMST1788, BMST45, C143, C217, FCB193, Rt1, Rt30, Rt7, Rt9, NVHRT16, OheQ, Rt6, Rt24, T40) методом ПЦР с последующим капиллярным электрофорезом на секвенаторе ABI 3130. Статистическая обработка результатов выполнена с использованием пакетов GenAlEx 6.5 и Microsoft Excel. Для каждого локуса рассчитывали следующие показатели: число аллелей (Na), эффективное число аллелей (Ne), индекс информативности Шеннона (I), наблюдаемую (Ho) и ожидаемую (He) гетерозиготность, а также индекс инбридинга (F). Выявлено от 1 до 10 аллелей на локус (среднее 4,6). Максимальное число аллелей зафиксировано для локуса FCB193 (10 аллелей), локусы Rt1 и Rt9 содержали по 9 аллелей. Локус C217 оказался мономорфным. Индекс Шеннона варьировал от 0,00 (C217) до 1,98 (FCB193). Средняя наблюдаемая гетерозиготность составила 0,393, ожидаемая - 0,482, индекс инбридинга - 0,121. Для восьми локусов отмечен дефицит гетерозигот (Ho < He), для четырёх - избыток. Наибольший дисбаланс выявлен в локусах BMST1788, BMST45, FCB193 и Rt7, что может свидетельствовать о влиянии инбридинга или селективного давления. Популяция алтае-саянских маралов в Тыве характеризуется умеренно высоким уровнем генетического разнообразия. Локусы FCB193, Rt1 и Rt9 рекомендованы для идентификации породной принадлежности и маркер-опосредованной селекции. Полученные данные могут быть использованы для мониторинга генофонда и разработки стратегий сохранения генетических ресурсов вида.
Ключевые словаМАРАЛЫ, АЛТАЕ-САЯНСКАЯ ПОРОДА, МИКРОСАТЕЛЛИТЫ, STR, МАРКЕРЫ, ПОЛИМОРФИЗМ, ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИДЕНТИФИКАЦИЯ, ГЕНОТИП, ЛОКУСЫ, АЛЛЕЛИ, ГЕТЕРОЗИГОТНОСТЬ
ЖурналЗоотехния
Номер выпуска6
Автор(ы)Монгуш С. Д., Павлова И. Ю., Рыжова Н. В., Комбу А. М., Аракчаа Ч. А., Баян-Оол Н. Н.